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飼用酶工程團隊開發(fā)出提高糖苷水解酶催化效率的新策略

2023-10-24 09:05:24 來源：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所 編輯： 田健 閱讀量：10365

　　近日啤都，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所姚斌院士團隊和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所微生物蛋白設(shè)計與智造創(chuàng)新團隊合作，開發(fā)了基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和分子進(jìn)化分析揽宵，提高糖苷水解酶催化活性的新策略溃锤。相關(guān)研究成果發(fā)表在《科學(xué)通報 (Science Bulletin)》。
 
　　糖苷水解酶是降解多糖的主要酶系援栗，在食品行業(yè)骄雇、飼料行業(yè)、農(nóng)副產(chǎn)品加工和農(nóng)副產(chǎn)品廢品降解等領(lǐng)域應(yīng)用廣泛帘惜，具有重要的應(yīng)用價值瑰侥。市場對糖苷水解酶的需求量逐年增加，但提高糖苷水解酶的催化效率稳析，發(fā)揮其最大催化潛力仍然是一個挑戰(zhàn)洗做。
 
　　該研究首先從碳水化合物活性酶數(shù)據(jù)庫(Carbohydrate-Active enZYmes Database, CAZy)數(shù)據(jù)庫中收集整理了119個糖苷水解酶家族的蛋白序列，建立了能夠識別糖苷水解酶家族和功能殘基的深度學(xué)習(xí)模型DeepGH彰居，通過10倍交叉驗證結(jié)果顯示DeepGH模型的預(yù)測準(zhǔn)確率為96.73%诚纸。隨后利用梯度加權(quán)類激活圖譜(Gradient-weighted Class Activation Mapping, Grad-CAM)方法提取分類相關(guān)特征，結(jié)合序列進(jìn)化信息對突變體進(jìn)行設(shè)計陈惰，最后獲得了具有7個氨基酸突變位點的殼聚糖酶突變體CHIS1754-MUT7畦徘。實驗結(jié)果表明，CHIS1754- MUT7的催化效率( k cat/ K m)是野生型的23.53倍抬闯。該蛋白理性策略計算效率高井辆，實驗成本低，具有顯著的優(yōu)勢，為酶催化效率的智能設(shè)計提供了一種新的途徑杯缺，具有廣泛的應(yīng)用前景蒸播。
 
　　中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所黃火清研究員、田健研究員和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所關(guān)菲菲副研究員為論文共同通訊作者萍肆，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所劉汗青袍榆、關(guān)菲菲、劉拓宇和楊麗鑫為論文共同第一作者笆犀」癫剑【閱讀原文】　

 作者：田健

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